Grensverleggende geneeskunde voor topreferente patiënten
Ontrafelen van complexe microbiele niches (VUmc)
Op sommige plaatsen in ons lichaam bevinden
zich grote hoeveelheden van tal van verschillende bacteriën. Voorbeelden
daarvan zijn de darmen, de huid, de mondflora, etc. waarin zich honderden
miljarden bacteriën bevinden. De precieze samenstelling van deze microbiële
flora verschilt van persoon tot persoon.
In het kader van de diagnostiek van
chronische infecties is het van belang de complexe microbiële flora, zoals de
darmflora, nauwkeurig te kunnen analyseren. Hiervoor beschikt de afdeling
Medisch Microbiologie en Infectiepreventie (MMI) over een unieke techniek
(IS-PRO) die op eenvoudige en snelle wijze (binnen 6hr) 98% van de bacteriële samenstelling van complexe flora
in kaart kan brengen.
De techniek is gebaseerd op het
amplificeren van de zgn. interspace (IS) regio's in het bacteriële DNA. De PCR
amplificeert alle aanwezige IS-elementen in één reactie. Vervolgens worden deze
producten op lengte gescheiden. Elke bacteriesoort heeft een specifieke IS-lengte.
De verschillende pieken (bacterieel
PROfiel) kunnen herleid worden op basis van de lengte van het PCR-product naar
een bacterienaam (species). Het gebruik van verschillende labels aan de primers
maakt het discriminerend vermogen zeer hoog.
Vergelijking van dergelijke bacteriële
profielen geeft inzicht in de samenstelling en afwijkingen van de microbiële
flora tijdens ziekte en gezondheid. Deze wijze van diagnostiek is uniek en
schept de mogelijkheid tot zeer specifiek op een patiënt gerichte therapie ('tailor
made') bij chronische darmproblemen (ziekte van Crohn, ulceratieve colitis) en
obesitas.
De methode kan op elk routine moleculair diagnostiek laboratorium
worden uitgevoerd en de data kunnen binnenkort via een centrale database
automatisch geïnterpreteerd worden.
De techniek maakt het tevens mogelijk om de
effecten die behandelingen (antibiotica, probiotica) hebben op de darmflora op
de voet te volgen. Onbekende bacteriesoorten alsmede pathogene bacteriën kunnen
eveneens geïdentificeerd worden. Momenteel wordt de methode uitgebreid naar
andere complexe microbiële flora's (huid, mond, parasitaire flora van de darm).
Meer informatie:
Contact:
prof. dr. P.H.M. Savelkoul
D. Budding MD (MMI)
dr. A. Van Bodegraven (Maag-, Darm- en
leverziekten)
afd. Medische Microbiologie &
Infectiepreventie, VUmc
de Boelelaan 1117
postbus 7057
1007 MB Amsterdam
klinmicrobiol@vumc.nl
Overige links:
ziekte van Crohn, algemene informatie van het Erfocentrum
Ulceratieve colitis, algemene informatie van het Erfocentrum
Obesitas, algemene informatie van het Erfocentrum
